1.硫酸铵沉淀法

原理：高浓度的盐离子在蛋白质溶液中可与蛋白质竞争水分子，从而破坏蛋白质表面的水化膜，降低其溶解度，使之从溶液中沉淀出来。各种蛋白质的溶解度不同，因而可利用不同浓度的盐溶液来沉淀不同的蛋白质。这种方法称之为盐析。

优点：硫酸铵因其溶解度大，温度系数小和不易使蛋白质变性。

缺点：蛋白提纯效果差，杂蛋白较多。

应用：抗体的粗纯化。                                         

2. 辛酸-硫酸铵法

原理：辛酸 (caprylic acid) 在偏酸条件下能与血清或腹水中除IgG外的其他蛋白质结合 并将其沉淀下来 ,IgG 则溶于上清液中 , 再用硫酸铵盐析 , 即可达到纯化 IgG 的目的。

优点：简单快捷，纯度较高。

缺点：受腹水影响较大，批间差异明显。

应用：主要用于单抗腹水的纯化。

3.亲和层析法

原理：亲和层析是一种吸附层析，抗原（或抗体）和相应的抗体（或抗原）发生特异性结合，而这种结合在一定的条件下又是可逆的。所以将抗原（或抗体）固相化后，就可以使存在液相中的相应抗体（或抗原）选择性地结合在固相载体上，借以与液相中的其他蛋白质分开，达到分离纯化的目的。

优点：此法具有高效、快速、简便、特异性强等优点。

缺点：成本高。

应用：诊断试剂等。                                

4.离子交换层析法

原理：离子交换层析（Ion Exchange Chromatography简称为IEC）是以离子交换剂为固定相，依据流动相中的组分离子与交换剂上的平衡离子进行可逆交换时的结合力大小的差别而进行分离的一种层析方法。

优点：条件可控性强，洗脱条件温和。

缺点：操作麻烦，分离效果不明显。

应用：广泛的应用于各种生化物质如氨基酸、蛋白、糖类、核苷酸等的分离纯化。 

5.凝胶过滤层析法

原理：凝胶过滤层析也称分子筛层析、排阻层析。是利用具有网状结构的凝胶的分子筛作用，根据被分离物质的分子大小不同来进行分离。

优点：它的突出优点是层析所用的凝胶属于惰性载体，不带电荷，吸附力弱，操作条件比较温和，可在相当广的温度范围下进行，不需要有机溶剂，并且对分离成分理化性质的保持有独到之处。对于高分子物质有很好的分离效果。

缺点：纯化量小，无法进行大规模纯化。

应用：广泛用于酶、蛋白质、氨基酸、多糖、激素、生物碱等物质的分离提纯。凝胶对热原有较强的吸附力，可用来去除无离子水中的致热原制备注射用水。蛋白质脱盐。